首先我們來簡單了解一下熒光顯微鏡和激光共聚焦顯微鏡的工作原理。
熒光顯微鏡(Fluorescence microscope) ：熒光顯微鏡是以紫外線為光源，樣品自身發光或者經過熒光染料或熒光抗體染色處理之后，照射被檢物體，受紫外激發產生熒光，探測器檢測，在顯微鏡下觀察物體的形狀及其所在位置。熒光顯微鏡用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等。

激光共聚焦顯微鏡(laser scanning confocal microscopy,LSCM)：全稱是激光掃描共聚焦熒光顯微鏡，是一種利用計算機、激光和圖像處理技術獲得生物樣品叁維數據，以激光作為光源，逐點激發樣品內熒光，采用精密針孔濾波技術，有效抑制了非聚焦平面的雜散光，具有層析成像能力和很高的成像信噪比。在熒光顯微鏡的基礎上添加了激光掃描裝置，激光從發射器發出，在照明針孔分成叁束，經過分光鏡反射，在物鏡處折射，聚焦于樣品的焦平面上，如果樣品中有被激光激發的熒光基團，就會產生熒光，按照激光進入的光路原路返回，返回的熒光在成像系統（一種可以把光信號轉化為電信號傳感器）中再次聚焦成相。因為在兩個位置（樣品和成像系統）聚焦，所以叫做共聚焦。

熒光顯微鏡和激光共聚焦顯微鏡的區別。

熒光顯微鏡又叫寬場熒光顯微鏡，當成像面較厚，焦面上方下方的干擾信號都會被觀察到，影響實驗結果，因此熒光顯微鏡只能觀察靜態的亞細胞結構。
激光共聚焦顯微鏡是在傳統熒光顯微鏡成像的基礎上，附加了激光掃描裝置和共軛聚焦裝置，通過計算機控制來進行數字化圖像采集和處理的系統。可以觀察亞細胞層次的一些生化變化，是目前*分子細胞生物學的分析儀器。
激光共聚焦顯微鏡比普通熒光顯微鏡獲得更高對比度、高分辨率圖像，同時具有高靈敏度，對檢測樣品無損傷、可靠和優良重復性。激光共聚焦顯微鏡具有更高的分辨率，實現多重熒光的同時可觀察并可形成清晰的叁維圖像等優點，能比寬場看到的成像面更薄，更清晰，在較以往更短的采集時間內輕松實現超高分辨率更大觀察視野成像。

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